Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Hacd3Q8K2C9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Hacd3Q8K2C9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms