Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rasgef1bQ8JZL7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rasgef1bQ8JZL7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rasgef1bQ8JZL7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rasgef1bQ8JZL7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rasgef1bQ8JZL7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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