Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trip10Q8CJ53 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms