Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc28bQ8CEG5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc28bQ8CEG5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc28bQ8CEG5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc28bQ8CEG5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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