Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms