Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Nhlrc3Q8CCH2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nhlrc3Q8CCH2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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