Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser1Q8C0C4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccser1Q8C0C4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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