Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctdsp2Q8BX07 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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