Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lmod1Q8BVA4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms