Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTW9

Pak4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak4Q8BTW9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pak4Q8BTW9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms