Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Abraxas1Q8BPZ8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms