Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BP99 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BP99 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Q8BP99 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BP99 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Q8BP99 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Q8BP99 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BP99 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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