Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smarcal1Q8BJL0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms