Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdca8Q8BHX3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms