Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms