Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD7

Npas4, Neuronal PAS domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas4Q8BGD7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Npas4Q8BGD7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas4Q8BGD7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas4Q8BGD7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas4Q8BGD7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas4Q8BGD7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas4Q8BGD7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas4Q8BGD7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas4Q8BGD7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas4Q8BGD7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas4Q8BGD7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Npas4Q8BGD7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms