Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms