Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms