Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc172Q810N9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms