Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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NanogQ80Z64 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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NanogQ80Z64 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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NanogQ80Z64 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NanogQ80Z64 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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NanogQ80Z64 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NanogQ80Z64 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NanogQ80Z64 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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NanogQ80Z64 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NanogQ80Z64 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NanogQ80Z64 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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