Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT45

Rragd, Ras-related GTP-binding protein D, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragdQ7TT45 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RragdQ7TT45 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms