Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rexo1Q7TT28 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms