Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LnpkQ7TQ95 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms