Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trappc6aQ78XR0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trappc6aQ78XR0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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