Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ubfd1Q78JW9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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