Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rph3alQ768S4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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