Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms