Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp8b3Q6UQ17 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp8b3Q6UQ17 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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