Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85bQ6PDY0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85bQ6PDY0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms