Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl2Q6PA06 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms