Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gga2Q6P5E6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gga2Q6P5E6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms