Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Podnl1Q6P3Y9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Podnl1Q6P3Y9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms