Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fndc3bQ6NWW9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc3bQ6NWW9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms