Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l2Q6KAU8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l2Q6KAU8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l2Q6KAU8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l2Q6KAU8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l2Q6KAU8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l2Q6KAU8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atg16l2Q6KAU8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg16l2Q6KAU8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg16l2Q6KAU8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg16l2Q6KAU8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg16l2Q6KAU8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg16l2Q6KAU8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg16l2Q6KAU8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg16l2Q6KAU8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms