Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctnna3Q65CL1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctnna3Q65CL1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms