Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Sf1Q64213 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sf1Q64213 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sf1Q64213 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sf1Q64213 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sf1Q64213 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sf1Q64213 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sf1Q64213 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Sf1Q64213 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sf1Q64213 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sf1Q64213 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms