Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Zfp248Q640N4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms