Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PrkciQ62074 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms