Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PtafrQ62035 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtafrQ62035 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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