Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dsg1aQ61495 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms