Protein–RNA interactions for Protein: Q61268

Apoc4, Apolipoprotein C-IV, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc4Q61268 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Apoc4Q61268 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms