Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms