Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tcf4Q60722 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms