Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SkiQ60698 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SkiQ60698 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SkiQ60698 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms