Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ItgaeQ60677 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ItgaeQ60677 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms