Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brip1Q5SXJ3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms