Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms