Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eme2Q56A04 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms