Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrig2Q52KR2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms