Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 4930552P12Rik-201ENSMUST00000181198 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 4930568E12Rik-202ENSMUST00000216694 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
SvipQ3UZP4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms